膽固醇是動物細胞膜中的重要脂質成分,與多種蛋白質存在相互作用。然而,由于膽固醇在水中的溶解度低,傳統(tǒng)研究方法存在局限性。2022年發(fā)表“Cholesterol Chip for the Study of Cholesterol–Protein Interactions Using SPR”利用SPR技術研究膽固醇與蛋白質的相互作用,揭示其動力學特性。
本研究合成生物素化膽固醇,將其固定在鏈霉親和素(SA)芯片上,通過SPR技術測量不同濃度的Hedgehog(Hh)和PTP1B蛋白與膽固醇的結合動力學,得到結合速率常數(shù)(ka)、解離速率常數(shù)(kd)和解離常數(shù)(KD)。
結合速率常數(shù)(ka):通過比較不同蛋白質濃度下的結合速率(即RU增加的速度),可以擬合出結合速率常數(shù)。ka值越大,表示結合速率越快。
解離速率常數(shù)(kd):解離相反映了蛋白質從膽固醇表面解離的速度。通過擬合解離過程,可以得到解離速率常數(shù)kd。kd值越大,表示解離速率越快。
解離常數(shù)(KD):KD是評價蛋白質與膽固醇結合親和力的關鍵參數(shù),它等于解離速率常數(shù)與結合速率常數(shù)的比值(KD = kd / ka)。KD值越小,表示結合親和力越強。
SPR實驗的關鍵步驟
樣品準備:合成生物素化膽固醇。同時,準備待測的膽固醇結合蛋白樣品。
實驗設置:將SA芯片安裝到SPR儀器上,設置實驗參數(shù),如流速、注射時間等。并將生物素化膽固醇固定在鏈霉親和素(SA)芯片上。
數(shù)據(jù)收集:將不同濃度的膽固醇結合蛋白樣品依次注射到芯片表面,通過SPR儀器實時監(jiān)測蛋白質與膽固醇的結合過程。
SPR實驗結果分析
Hh與膽固醇的相互作用:結合速率常數(shù)ka為1.81×105 (±500)(1/Ms),解離速率常數(shù)kd為2.60×10-3(±1.20×10-4)(1/s),解離常數(shù)KD約為14 nM。
PTP1B與膽固醇的相互作用:結合速率常數(shù)ka為1.33×104 (±220)(1/Ms),解離速率常數(shù)kd為1.9×10-3 (±7.4×10-6)(1/s),解離常數(shù)KD約為85 nM。
SPR實驗的優(yōu)勢
實時監(jiān)測:SPR技術可以實時監(jiān)測生物分子間的相互作用過程,無需對樣品進行標記或處理。
高靈敏度:SPR儀器對折射率的變化非常敏感,可以檢測到納摩爾級別的生物分子相互作用。
樣品需求量少:與核磁共振(NMR)或X射線晶體學等方法相比,SPR技術具有樣品需求量少、實時測量動力學參數(shù)等優(yōu)勢。
研究結論:成功合成了生物素化膽固醇并將其固定在SA芯片上,通過SPR技術研究了膽固醇與Hh和PTP1B的相互作用動力學。
該方法為研究膽固醇與其他蛋白質的相互作用提供了新的途徑,有望促進對膽固醇生物學功能的深入理解。
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